Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms