Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIF1AQ16665 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIF1AQ16665 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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