Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX2Q16385 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX2Q16385 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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