Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD1Q15797 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD1Q15797 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms