Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPNMBQ14956 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPNMBQ14956 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
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