Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NID2Q14112 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NID2Q14112 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NID2Q14112 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NID2Q14112 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NID2Q14112 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NID2Q14112 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NID2Q14112 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NID2Q14112 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NID2Q14112 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NID2Q14112 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NID2Q14112 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NID2Q14112 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NID2Q14112 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NID2Q14112 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NID2Q14112 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NID2Q14112 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NID2Q14112 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NID2Q14112 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NID2Q14112 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NID2Q14112 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NID2Q14112 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NID2Q14112 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NID2Q14112 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NID2Q14112 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NID2Q14112 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NID2Q14112 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NID2Q14112 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NID2Q14112 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NID2Q14112 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NID2Q14112 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NID2Q14112 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NID2Q14112 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NID2Q14112 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NID2Q14112 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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