Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SCARB2Q14108 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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