Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRSF5Q13243 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF5Q13243 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRSF5Q13243 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRSF5Q13243 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF5Q13243 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF5Q13243 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF5Q13243 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF5Q13243 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF5Q13243 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF5Q13243 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRSF5Q13243 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRSF5Q13243 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms