Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF3Q13114 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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