Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAX2Q02962 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX2Q02962 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms