Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms