Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHC1P78364 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHC1P78364 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHC1P78364 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHC1P78364 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHC1P78364 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHC1P78364 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHC1P78364 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHC1P78364 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHC1P78364 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHC1P78364 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHC1P78364 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PHC1P78364 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHC1P78364 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHC1P78364 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHC1P78364 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHC1P78364 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHC1P78364 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHC1P78364 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHC1P78364 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHC1P78364 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHC1P78364 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHC1P78364 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHC1P78364 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHC1P78364 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms