Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC10P48553 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC10P48553 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms