Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHKA1P46020 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHKA1P46020 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHKA1P46020 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms