Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2BP42772 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms