Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARL3P36405 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARL3P36405 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARL3P36405 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARL3P36405 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARL3P36405 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARL3P36405 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARL3P36405 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARL3P36405 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARL3P36405 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARL3P36405 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARL3P36405 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARL3P36405 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARL3P36405 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARL3P36405 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARL3P36405 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARL3P36405 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL3P36405 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL3P36405 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL3P36405 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL3P36405 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARL3P36405 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL3P36405 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL3P36405 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL3P36405 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL3P36405 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL3P36405 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARL3P36405 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms