Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMB4P28070 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms