Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEFLP07196 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEFLP07196 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEFLP07196 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEFLP07196 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFLP07196 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFLP07196 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFLP07196 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFLP07196 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEFLP07196 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFLP07196 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFLP07196 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFLP07196 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFLP07196 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEFLP07196 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEFLP07196 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFLP07196 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFLP07196 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFLP07196 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFLP07196 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFLP07196 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFLP07196 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFLP07196 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFLP07196 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFLP07196 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEFLP07196 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEFLP07196 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFLP07196 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFLP07196 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFLP07196 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFLP07196 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFLP07196 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFLP07196 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFLP07196 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFLP07196 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFLP07196 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFLP07196 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFLP07196 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFLP07196 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFLP07196 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFLP07196 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFLP07196 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFLP07196 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFLP07196 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFLP07196 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFLP07196 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFLP07196 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFLP07196 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFLP07196 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFLP07196 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFLP07196 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFLP07196 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFLP07196 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFLP07196 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFLP07196 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFLP07196 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFLP07196 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms