Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1P04632 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1P04632 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms