Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRNPP04156 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRNPP04156 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRNPP04156 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRNPP04156 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRNPP04156 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRNPP04156 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRNPP04156 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRNPP04156 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRNPP04156 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRNPP04156 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRNPP04156 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRNPP04156 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRNPP04156 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRNPP04156 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRNPP04156 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRNPP04156 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRNPP04156 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRNPP04156 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRNPP04156 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRNPP04156 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRNPP04156 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRNPP04156 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRNPP04156 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRNPP04156 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRNPP04156 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRNPP04156 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRNPP04156 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRNPP04156 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRNPP04156 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRNPP04156 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRNPP04156 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRNPP04156 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRNPP04156 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRNPP04156 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRNPP04156 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRNPP04156 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRNPP04156 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRNPP04156 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRNPP04156 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRNPP04156 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRNPP04156 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRNPP04156 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRNPP04156 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRNPP04156 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRNPP04156 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms