Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	YHR214W	YHR214W	612 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YAR066W	YAR066W	612 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	ATG33	YLR356W	594 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	MGR2	YPL098C	342 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	SCD6	YPR129W	1050 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	MYO3	YKL129C	3819 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	PTR3	YFR029W	2037 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	BNA6	YFR047C	888 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	AIM22	YJL046W	1230 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	GON7	YJL184W	372 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	RAD17	YOR368W	1206 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	CHD1	YER164W	4407 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	PRP19	YLL036C	1512 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	LOH1	YJL038C	660 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YAL056C-A	YAL056C-A	351 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	PAM18	YLR008C	507 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YDC1	YPL087W	954 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	YPR071W	YPR071W	636 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VAR1	P02381	PTA1	YAL043C	2358 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	KDX1	YKL161C	1302 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	MET17	YLR303W	1335 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	HSP31	YDR533C	714 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	KRE9	YJL174W	831 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	YNL296W	YNL296W	315 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	ECM23	YPL021W	564 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	PEP7	YDR323C	1548 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	YIL001W	YIL001W	1542 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	EMC1	YCL045C	2283 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	EMP47	YFL048C	1338 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	SNF11	YDR073W	510 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	PDX1	YGR193C	1233 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	YLF2	YHL014C	1218 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	CIA2	YHR122W	696 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	PCL1	YNL289W	840 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	XRS2	YDR369C	2565 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	LCB2	YDR062W	1686 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	SPR6	YER115C	576 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	SOL4	YGR248W	768 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	PAU17	YLL025W	375 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	RPS19A	YOL121C	435 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	RGS2	YOR107W	930 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	BRE4	YDL231C	3378 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	DIT1	YDR403W	1611 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	FAR10	YLR238W	1437 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	MCM7	YBR202W	2538 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	RPO21	YDL140C	5202 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	REB1	YBR049C	2433 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	ALG9	YNL219C	1668 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	FLO10	YKR102W	3510 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	APL4	YPR029C	2499 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	THI13	YDL244W	1023 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	PHM6	YDR281C	315 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	THI11	YJR156C	1023 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	DBR1	YKL149C	1218 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	YLR407W	YLR407W	687 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	YBR016W	YBR016W	387 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	snR17a	snR17a	333 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	PWR1	PWR1	941 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	snR37	snR37	386 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	SRB6	YBR253W	366 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	IDS2	YJL146W	1410 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	SRS2	YJL092W	3525 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	RTS1	YOR014W	2274 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	RCM1	YNL022C	1473 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	YDL094C	YDL094C	510 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	PHO13	YDL236W	939 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	RPL24A	YGL031C	468 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	YIL171W	YIL171W	330 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	ECM15	YBL001C	315 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	SCP1	YOR367W	603 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	SMP1	YBR182C	1359 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	DPB2	YPR175W	2070 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	SSH1	YBR283C	1473 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	BUD8	YLR353W	1812 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	YIL171W-A	YIL171W-A	453 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	YJL220W	YJL220W	453 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	IDP2	YLR174W	1239 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	ARG80	YMR042W	534 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	STP22	YCL008C	1158 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	PBN1	YCL052C	1251 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	LAS1	YKR063C	1509 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	MSN4	YKL062W	1893 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	SWI1	YPL016W	3945 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	GCR1	YPL075W	2358 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	SPT16	YGL207W	3108 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	HEF3	YNL014W	3135 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.21	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	ZRC1	YMR243C	1329 nt		3.21	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	BIK1	YCL029C	1323 nt		3.21	□□□□□ -1.89
VAR1	P02381	TAF11	YML015C	1041 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VAR1	P02381	YBR219C	YBR219C	384 nt		3.21	□□□□□ -1.9

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