Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-CO1P00395 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-CO1P00395 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-CO1P00395 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-CO1P00395 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-CO1P00395 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-CO1P00395 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-CO1P00395 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-CO1P00395 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-CO1P00395 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-CO1P00395 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms