Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNE2O96020 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNE2O96020 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNE2O96020 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms