Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL3O95236 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL3O95236 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL3O95236 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL3O95236 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL3O95236 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL3O95236 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL3O95236 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL3O95236 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOL3O95236 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOL3O95236 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOL3O95236 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOL3O95236 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOL3O95236 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOL3O95236 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL3O95236 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL3O95236 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL3O95236 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL3O95236 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL3O95236 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL3O95236 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOL3O95236 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL3O95236 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL3O95236 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL3O95236 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL3O95236 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL3O95236 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL3O95236 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL3O95236 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL3O95236 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOL3O95236 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOL3O95236 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOL3O95236 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOL3O95236 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL3O95236 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL3O95236 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL3O95236 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL3O95236 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL3O95236 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL3O95236 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL3O95236 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL3O95236 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL3O95236 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOL3O95236 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms