Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD6O43541 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD6O43541 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms