Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
U3KQE9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
U3KQE9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
U3KQE9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
U3KQE9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
U3KQE9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U3KQE9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U3KQE9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
U3KQE9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
U3KQE9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
U3KQE9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
U3KQE9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
U3KQE9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
U3KQE9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
U3KQE9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
U3KQE9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
U3KQE9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
U3KQE9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
U3KQE9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
U3KQE9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
U3KQE9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
U3KQE9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
U3KQE9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
U3KQE9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
U3KQE9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U3KQE9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
U3KQE9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
U3KQE9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U3KQE9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U3KQE9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
U3KQE9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
U3KQE9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U3KQE9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms