Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms