Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C4Q9UKN8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms