Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RABGEF1Q9UJ41 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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