Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms