Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK12Q9NYV4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms