Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDAP2Q9NXN4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms