Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM100Q9NV29 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM100Q9NV29 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms