Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1088.6 ms