Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA6CQ9H3T2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6CQ9H3T2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms