Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM3Q9BZL3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms