Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNQ99608 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNQ99608 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNQ99608 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNQ99608 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNQ99608 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNQ99608 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNQ99608 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNQ99608 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNQ99608 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNQ99608 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNQ99608 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNQ99608 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NDNQ99608 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDNQ99608 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNQ99608 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNQ99608 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNQ99608 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNQ99608 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNQ99608 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNQ99608 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNQ99608 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNQ99608 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNQ99608 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDNQ99608 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDNQ99608 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDNQ99608 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDNQ99608 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDNQ99608 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDNQ99608 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDNQ99608 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDNQ99608 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNQ99608 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNQ99608 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNQ99608 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNQ99608 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNQ99608 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNQ99608 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNQ99608 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDNQ99608 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDNQ99608 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms