Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.5 ms