Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms