Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3KBP1Q96B97 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms