Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP33Q8TEY7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms