Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RSBN1Q5VWQ0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RSBN1Q5VWQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms