Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBAP2Q5T6F2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms