Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMTC4Q5T4D3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMTC4Q5T4D3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC4Q5T4D3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms