Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A3Q16572 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC18A3Q16572 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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