Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN1Q14699 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN1Q14699 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN1Q14699 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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