Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NID2Q14112 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NID2Q14112 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NID2Q14112 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NID2Q14112 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NID2Q14112 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NID2Q14112 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NID2Q14112 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NID2Q14112 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NID2Q14112 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NID2Q14112 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NID2Q14112 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NID2Q14112 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NID2Q14112 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NID2Q14112 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NID2Q14112 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NID2Q14112 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NID2Q14112 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NID2Q14112 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NID2Q14112 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NID2Q14112 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NID2Q14112 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NID2Q14112 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NID2Q14112 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NID2Q14112 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NID2Q14112 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NID2Q14112 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NID2Q14112 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NID2Q14112 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NID2Q14112 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NID2Q14112 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NID2Q14112 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NID2Q14112 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NID2Q14112 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NID2Q14112 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NID2Q14112 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NID2Q14112 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NID2Q14112 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NID2Q14112 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NID2Q14112 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NID2Q14112 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NID2Q14112 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NID2Q14112 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NID2Q14112 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NID2Q14112 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NID2Q14112 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NID2Q14112 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NID2Q14112 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NID2Q14112 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NID2Q14112 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NID2Q14112 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NID2Q14112 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NID2Q14112 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NID2Q14112 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NID2Q14112 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NID2Q14112 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NID2Q14112 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NID2Q14112 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NID2Q14112 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NID2Q14112 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NID2Q14112 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NID2Q14112 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NID2Q14112 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NID2Q14112 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NID2Q14112 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NID2Q14112 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NID2Q14112 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NID2Q14112 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NID2Q14112 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NID2Q14112 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NID2Q14112 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NID2Q14112 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NID2Q14112 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NID2Q14112 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NID2Q14112 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NID2Q14112 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NID2Q14112 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NID2Q14112 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NID2Q14112 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NID2Q14112 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NID2Q14112 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NID2Q14112 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NID2Q14112 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NID2Q14112 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NID2Q14112 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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