Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTCH1Q13635 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
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