Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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TRAF3Q13114 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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TRAF3Q13114 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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TRAF3Q13114 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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TRAF3Q13114 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAF3Q13114 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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TRAF3Q13114 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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TRAF3Q13114 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF3Q13114 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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