Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 CUE5YOR042W 1236 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 CDC4YFL009W 2340 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 MMT2YPL224C 1455 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 GPB1YOR371C 2694 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 TFA1YKL028W 1449 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 snR63snR63 255 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YDL012CYDL012C 324 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 ARC1YGL105W 1131 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 VMA22YHR060W 546 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 GON7YJL184W 372 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 JLP1YLL057C 1239 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 NMD4YLR363C 657 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 TLG2YOL018C 1194 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 SOF1YLL011W 1470 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 STE20YHL007C 2820 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 MMT1YMR177W 1533 nt4.67□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 ENT1YDL161W 1365 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 GCN20YFR009W 2259 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 HSP82YPL240C 2130 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 SER33YIL074C 1410 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YCR050CYCR050C 309 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YGR219WYGR219W 342 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 PNP1YLR209C 936 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 CPR3YML078W 549 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 SOL1YNR034W 966 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YDC1YPL087W 954 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 NNK1YKL171W 2787 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 SYP1YCR030C 2613 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 SSA2YLL024C 1920 nt4.66□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 MCM2YBL023C 2607 nt4.65□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 HIR2YOR038C 2628 nt4.65□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 IKS1YJL057C 2004 nt4.65□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YDR274CYDR274C 372 nt4.65□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YDR417CYDR417C 372 nt4.65□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 LPP1YDR503C 825 nt4.65□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 TEF4YKL081W 1239 nt4.65□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 HEK2YBL032W 1146 nt4.65□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 GPI2YPL076W 843 nt4.65□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 HMS1YOR032C 1305 nt4.65□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 COT1YOR316C 1320 nt4.65□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 MDM38YOL027C 1722 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 CDC9YDL164C 2268 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 PEX19YDL065C 1029 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YFR035CYFR035C 345 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 ARO2YGL148W 1131 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 CIR1YGR207C 786 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 MDG1YNL173C 1101 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 RRP40YOL142W 723 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 OPY2YPR075C 1083 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 CNS1YBR155W 1158 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 PDR10YOR328W 4695 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YMR102CYMR102C 2505 nt4.64□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YJL206CYJL206C 2277 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 FRE1YLR214W 2061 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 ASK10YGR097W 3441 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 NOP16YER002W 696 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 TIF34YMR146C 1044 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YNL174WYNL174W 573 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 AIM39YOL053W 1188 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 IRC14YOR135C 342 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 CAF4YKR036C 1932 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 SRO9YCL037C 1305 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 MIH1YMR036C 1665 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 HFA1YMR207C 6372 nt4.63□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 SLM5YCR024C 1479 nt4.62□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 HRR25YPL204W 1485 nt4.62□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 TDA7YNL176C 1911 nt4.62□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 ALG11YNL048W 1647 nt4.62□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YDL026WYDL026W 312 nt4.62□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 SDT1YGL224C 843 nt4.62□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 PEX22YAL055W 543 nt4.62□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 RAD10YML095C 633 nt4.62□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 NHP6AYPR052C 282 nt4.62□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 SHE3YBR130C 1278 nt4.62□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 IMD3YLR432W 1572 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 BUD7YOR299W 2241 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YEL067CYEL067C 588 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 SCS2YER120W 735 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 AUA1YFL010W-A 285 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 VPS29YHR012W 849 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 SPO20YMR017W 1194 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YMR084WYMR084W 789 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 SPS4YOR313C 1017 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YCL012CYCL012C 405 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 GAL4YPL248C 2646 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 DRN1YGR093W 1524 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 LYS2YBR115C 4179 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 RKM3YBR030W 1659 nt4.61□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 SWC3YAL011W 1878 nt4.6□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 DOA1YKL213C 2148 nt4.6□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 COQ4YDR204W 1008 nt4.6□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 RPS1BYML063W 768 nt4.6□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 VPS21YOR089C 633 nt4.6□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 TRS33YOR115C 807 nt4.6□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 SET6YPL165C 1122 nt4.6□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 YPL199CYPL199C 723 nt4.6□□□□□ -1.67
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